Els animals de L’Aquàrium, generalment carnívors, per poder estar en bones condicions, cal que mengin el millor possible. Per aquesta raó, diàriament es preparen dietes a base de peix sencer o trossejat, crancs, musclos, plàncton viu i complements vegetals i vitamínics.
Cada dia, un equip de professionals de L’Aquàrium prepara 150 menús diferents per alimentar els animals, d’una forma adequada. Normalment, l’aliment es diposita a l’aigua, perquè siguin els mateixos animals els que vagin a menjar a la superfície de l’aquari.

Els animals dels aquaris mediterranis mengen tres vegades per setmana, i els tropicals, dues vegades diàries. Això és perquè com menys temperatura tingui l’aigua, els peixos necessiten menys aliment. Així, als aquaris mediterranis l’aigua està a 18 graus, mentre que als tropicals puja a 25-26 graus.